Otra de las grandes apuestas de El Cajón son sus aguas termales. En la parte baja de las cortinas las personas pueden darse un delicioso baño y disfrutar estás aguas medicinales. Los visitantes se sorprenden cuando observan aquellas piscinas que son adornadas con pequeñas banquitas y además están cubiertas por las sombras que brindan los árboles y el puente.

El Cajón cuenta con dos piscinas: para grandes y chicos. El agua que reside en las piscinas nace de una pequeña roca que esta muy cerca de esta área. Los responsables del turismo en la Represa Hidroeléctrica Francisco Morazán siempre se han procurado de cuidar y proteger este yacimiento.

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Sin duda, es una buena opción para pasar con la familia o amigos. Todo el lugar muy es seguro y además el ambiente que se vive es muy agradable.